Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf1Q61999 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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Odf1Q61999 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
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Odf1Q61999 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
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Odf1Q61999 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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Odf1Q61999 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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Odf1Q61999 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Odf1Q61999 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms