Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gli3Q61602 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Gli3Q61602 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gli3Q61602 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gli3Q61602 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Gli3Q61602 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gli3Q61602 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gli3Q61602 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gli3Q61602 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Gli3Q61602 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Gli3Q61602 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gli3Q61602 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gli3Q61602 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gli3Q61602 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gli3Q61602 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gli3Q61602 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gli3Q61602 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gli3Q61602 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gli3Q61602 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gli3Q61602 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gli3Q61602 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gli3Q61602 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gli3Q61602 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gli3Q61602 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gli3Q61602 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gli3Q61602 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gli3Q61602 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gli3Q61602 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gli3Q61602 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gli3Q61602 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gli3Q61602 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gli3Q61602 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gli3Q61602 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gli3Q61602 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gli3Q61602 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gli3Q61602 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gli3Q61602 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gli3Q61602 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gli3Q61602 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gli3Q61602 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gli3Q61602 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gli3Q61602 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gli3Q61602 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gli3Q61602 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gli3Q61602 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gli3Q61602 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Gli3Q61602 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gli3Q61602 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gli3Q61602 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gli3Q61602 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gli3Q61602 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gli3Q61602 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Gli3Q61602 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gli3Q61602 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gli3Q61602 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gli3Q61602 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gli3Q61602 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gli3Q61602 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gli3Q61602 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gli3Q61602 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gli3Q61602 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gli3Q61602 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gli3Q61602 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Gli3Q61602 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gli3Q61602 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gli3Q61602 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gli3Q61602 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gli3Q61602 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gli3Q61602 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gli3Q61602 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gli3Q61602 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gli3Q61602 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gli3Q61602 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Gli3Q61602 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gli3Q61602 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Gli3Q61602 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Gli3Q61602 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gli3Q61602 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gli3Q61602 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gli3Q61602 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gli3Q61602 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gli3Q61602 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gli3Q61602 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gli3Q61602 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gli3Q61602 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gli3Q61602 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gli3Q61602 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gli3Q61602 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gli3Q61602 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gli3Q61602 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Gli3Q61602 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gli3Q61602 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gli3Q61602 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gli3Q61602 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gli3Q61602 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gli3Q61602 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gli3Q61602 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Gli3Q61602 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gli3Q61602 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gli3Q61602 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms