Protein–RNA interactions for Protein: Q61500

Itm2a, Integral membrane protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itm2aQ61500 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itm2aQ61500 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Itm2aQ61500 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Itm2aQ61500 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Itm2aQ61500 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Itm2aQ61500 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itm2aQ61500 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms