Protein–RNA interactions for Protein: Q61476

Cd55b, Complement decay-accelerating factor transmembrane isoform, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd55bQ61476 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd55bQ61476 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd55bQ61476 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd55bQ61476 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd55bQ61476 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd55bQ61476 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd55bQ61476 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd55bQ61476 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd55bQ61476 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd55bQ61476 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd55bQ61476 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd55bQ61476 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd55bQ61476 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd55bQ61476 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd55bQ61476 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd55bQ61476 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd55bQ61476 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd55bQ61476 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd55bQ61476 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd55bQ61476 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd55bQ61476 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd55bQ61476 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd55bQ61476 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd55bQ61476 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd55bQ61476 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd55bQ61476 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd55bQ61476 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd55bQ61476 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd55bQ61476 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd55bQ61476 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd55bQ61476 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd55bQ61476 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd55bQ61476 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd55bQ61476 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd55bQ61476 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd55bQ61476 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd55bQ61476 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd55bQ61476 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd55bQ61476 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd55bQ61476 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd55bQ61476 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd55bQ61476 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd55bQ61476 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd55bQ61476 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd55bQ61476 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd55bQ61476 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd55bQ61476 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd55bQ61476 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd55bQ61476 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd55bQ61476 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd55bQ61476 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd55bQ61476 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd55bQ61476 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cd55bQ61476 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cd55bQ61476 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cd55bQ61476 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cd55bQ61476 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cd55bQ61476 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd55bQ61476 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd55bQ61476 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd55bQ61476 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd55bQ61476 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Cd55bQ61476 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Cd55bQ61476 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd55bQ61476 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd55bQ61476 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Cd55bQ61476 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd55bQ61476 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd55bQ61476 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd55bQ61476 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd55bQ61476 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd55bQ61476 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd55bQ61476 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd55bQ61476 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd55bQ61476 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd55bQ61476 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd55bQ61476 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd55bQ61476 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd55bQ61476 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd55bQ61476 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd55bQ61476 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd55bQ61476 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd55bQ61476 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd55bQ61476 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd55bQ61476 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd55bQ61476 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd55bQ61476 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd55bQ61476 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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