Protein–RNA interactions for Protein: Q61412

Vsx2, Visual system homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx2Q61412 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms