Protein–RNA interactions for Protein: Q61285

Abcd2, ATP-binding cassette sub-family D member 2, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd2Q61285 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Abcd2Q61285 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms