Protein–RNA interactions for Protein: Q61194

Pik3c2a, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3c2aQ61194 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pik3c2aQ61194 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pik3c2aQ61194 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Pik3c2aQ61194 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pik3c2aQ61194 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pik3c2aQ61194 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pik3c2aQ61194 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pik3c2aQ61194 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pik3c2aQ61194 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pik3c2aQ61194 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pik3c2aQ61194 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pik3c2aQ61194 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pik3c2aQ61194 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pik3c2aQ61194 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pik3c2aQ61194 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pik3c2aQ61194 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pik3c2aQ61194 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pik3c2aQ61194 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pik3c2aQ61194 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pik3c2aQ61194 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pik3c2aQ61194 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pik3c2aQ61194 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pik3c2aQ61194 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pik3c2aQ61194 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pik3c2aQ61194 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pik3c2aQ61194 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pik3c2aQ61194 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pik3c2aQ61194 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Pik3c2aQ61194 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Pik3c2aQ61194 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Pik3c2aQ61194 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Pik3c2aQ61194 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pik3c2aQ61194 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pik3c2aQ61194 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pik3c2aQ61194 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pik3c2aQ61194 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pik3c2aQ61194 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pik3c2aQ61194 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pik3c2aQ61194 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pik3c2aQ61194 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pik3c2aQ61194 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pik3c2aQ61194 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pik3c2aQ61194 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pik3c2aQ61194 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Pik3c2aQ61194 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pik3c2aQ61194 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pik3c2aQ61194 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pik3c2aQ61194 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pik3c2aQ61194 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pik3c2aQ61194 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pik3c2aQ61194 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Pik3c2aQ61194 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pik3c2aQ61194 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pik3c2aQ61194 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pik3c2aQ61194 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pik3c2aQ61194 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pik3c2aQ61194 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pik3c2aQ61194 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pik3c2aQ61194 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Pik3c2aQ61194 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pik3c2aQ61194 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pik3c2aQ61194 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pik3c2aQ61194 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pik3c2aQ61194 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pik3c2aQ61194 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pik3c2aQ61194 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Pik3c2aQ61194 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pik3c2aQ61194 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pik3c2aQ61194 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pik3c2aQ61194 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Pik3c2aQ61194 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pik3c2aQ61194 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pik3c2aQ61194 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pik3c2aQ61194 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Pik3c2aQ61194 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pik3c2aQ61194 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pik3c2aQ61194 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pik3c2aQ61194 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pik3c2aQ61194 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pik3c2aQ61194 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pik3c2aQ61194 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pik3c2aQ61194 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pik3c2aQ61194 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pik3c2aQ61194 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pik3c2aQ61194 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pik3c2aQ61194 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pik3c2aQ61194 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pik3c2aQ61194 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pik3c2aQ61194 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pik3c2aQ61194 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pik3c2aQ61194 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pik3c2aQ61194 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pik3c2aQ61194 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Pik3c2aQ61194 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pik3c2aQ61194 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pik3c2aQ61194 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pik3c2aQ61194 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pik3c2aQ61194 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pik3c2aQ61194 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pik3c2aQ61194 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms