Protein–RNA interactions for Protein: Q61187

Tsg101, Tumor susceptibility gene 101 protein, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsg101Q61187 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tsg101Q61187 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tsg101Q61187 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tsg101Q61187 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tsg101Q61187 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tsg101Q61187 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tsg101Q61187 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tsg101Q61187 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tsg101Q61187 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsg101Q61187 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsg101Q61187 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsg101Q61187 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsg101Q61187 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsg101Q61187 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsg101Q61187 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsg101Q61187 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsg101Q61187 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsg101Q61187 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsg101Q61187 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsg101Q61187 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsg101Q61187 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsg101Q61187 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsg101Q61187 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsg101Q61187 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsg101Q61187 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsg101Q61187 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsg101Q61187 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsg101Q61187 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsg101Q61187 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsg101Q61187 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsg101Q61187 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsg101Q61187 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsg101Q61187 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsg101Q61187 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsg101Q61187 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsg101Q61187 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsg101Q61187 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsg101Q61187 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsg101Q61187 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsg101Q61187 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsg101Q61187 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsg101Q61187 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tsg101Q61187 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tsg101Q61187 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tsg101Q61187 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tsg101Q61187 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tsg101Q61187 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tsg101Q61187 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tsg101Q61187 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tsg101Q61187 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tsg101Q61187 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tsg101Q61187 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tsg101Q61187 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tsg101Q61187 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tsg101Q61187 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tsg101Q61187 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tsg101Q61187 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tsg101Q61187 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tsg101Q61187 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tsg101Q61187 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tsg101Q61187 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tsg101Q61187 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tsg101Q61187 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tsg101Q61187 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tsg101Q61187 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tsg101Q61187 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tsg101Q61187 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tsg101Q61187 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tsg101Q61187 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tsg101Q61187 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tsg101Q61187 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tsg101Q61187 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tsg101Q61187 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tsg101Q61187 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tsg101Q61187 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tsg101Q61187 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tsg101Q61187 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tsg101Q61187 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tsg101Q61187 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tsg101Q61187 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tsg101Q61187 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tsg101Q61187 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tsg101Q61187 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tsg101Q61187 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tsg101Q61187 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tsg101Q61187 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tsg101Q61187 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tsg101Q61187 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tsg101Q61187 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tsg101Q61187 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tsg101Q61187 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tsg101Q61187 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tsg101Q61187 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tsg101Q61187 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tsg101Q61187 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tsg101Q61187 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tsg101Q61187 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tsg101Q61187 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tsg101Q61187 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tsg101Q61187 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms