Protein–RNA interactions for Protein: Q61060

Foxd3, Forkhead box protein D3, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd3Q61060 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Foxd3Q61060 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms