Protein–RNA interactions for Protein: Q61056

Trpc1, Short transient receptor potential channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc1Q61056 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trpc1Q61056 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms