Protein–RNA interactions for Protein: Q60961

Laptm4a, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Laptm4aQ60961 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms