Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Neurod1Q60867 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Neurod1Q60867 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Neurod1Q60867 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Neurod1Q60867 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Neurod1Q60867 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Neurod1Q60867 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Neurod1Q60867 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Neurod1Q60867 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Neurod1Q60867 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms