Protein–RNA interactions for Protein: Q60846

Tnfrsf8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf8Q60846 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf8Q60846 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf8Q60846 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf8Q60846 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf8Q60846 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf8Q60846 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf8Q60846 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf8Q60846 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf8Q60846 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf8Q60846 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf8Q60846 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf8Q60846 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf8Q60846 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf8Q60846 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf8Q60846 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf8Q60846 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf8Q60846 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf8Q60846 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf8Q60846 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf8Q60846 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf8Q60846 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf8Q60846 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf8Q60846 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf8Q60846 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf8Q60846 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf8Q60846 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf8Q60846 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf8Q60846 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf8Q60846 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf8Q60846 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf8Q60846 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf8Q60846 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf8Q60846 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf8Q60846 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf8Q60846 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf8Q60846 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf8Q60846 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf8Q60846 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf8Q60846 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf8Q60846 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf8Q60846 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf8Q60846 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf8Q60846 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf8Q60846 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf8Q60846 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf8Q60846 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf8Q60846 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf8Q60846 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf8Q60846 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf8Q60846 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf8Q60846 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf8Q60846 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf8Q60846 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf8Q60846 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf8Q60846 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf8Q60846 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf8Q60846 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf8Q60846 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf8Q60846 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf8Q60846 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf8Q60846 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf8Q60846 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf8Q60846 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf8Q60846 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf8Q60846 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf8Q60846 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf8Q60846 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf8Q60846 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf8Q60846 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf8Q60846 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf8Q60846 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tnfrsf8Q60846 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf8Q60846 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf8Q60846 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf8Q60846 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf8Q60846 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf8Q60846 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf8Q60846 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf8Q60846 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf8Q60846 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf8Q60846 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf8Q60846 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf8Q60846 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf8Q60846 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf8Q60846 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfrsf8Q60846 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfrsf8Q60846 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfrsf8Q60846 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfrsf8Q60846 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfrsf8Q60846 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfrsf8Q60846 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfrsf8Q60846 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfrsf8Q60846 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfrsf8Q60846 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfrsf8Q60846 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfrsf8Q60846 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfrsf8Q60846 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfrsf8Q60846 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfrsf8Q60846 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfrsf8Q60846 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms