Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cnot7Q60809 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms