Protein–RNA interactions for Protein: Q60793

Klf4, Krueppel-like factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf4Q60793 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klf4Q60793 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms