Protein–RNA interactions for Protein: Q60772

Cdkn2c, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2cQ60772 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cdkn2cQ60772 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkn2cQ60772 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms