Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atf3Q60765 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atf3Q60765 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atf3Q60765 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atf3Q60765 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atf3Q60765 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atf3Q60765 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atf3Q60765 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atf3Q60765 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atf3Q60765 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atf3Q60765 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atf3Q60765 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atf3Q60765 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atf3Q60765 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atf3Q60765 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atf3Q60765 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atf3Q60765 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atf3Q60765 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atf3Q60765 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Atf3Q60765 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atf3Q60765 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atf3Q60765 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atf3Q60765 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atf3Q60765 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atf3Q60765 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atf3Q60765 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Atf3Q60765 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atf3Q60765 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atf3Q60765 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms