Protein–RNA interactions for Protein: Q60696

Pmel, Melanocyte protein PMEL, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmelQ60696 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PmelQ60696 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PmelQ60696 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PmelQ60696 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PmelQ60696 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PmelQ60696 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PmelQ60696 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PmelQ60696 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PmelQ60696 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PmelQ60696 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PmelQ60696 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PmelQ60696 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PmelQ60696 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PmelQ60696 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PmelQ60696 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PmelQ60696 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PmelQ60696 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PmelQ60696 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PmelQ60696 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PmelQ60696 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PmelQ60696 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PmelQ60696 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PmelQ60696 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PmelQ60696 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PmelQ60696 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PmelQ60696 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PmelQ60696 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PmelQ60696 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PmelQ60696 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PmelQ60696 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PmelQ60696 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PmelQ60696 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PmelQ60696 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PmelQ60696 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PmelQ60696 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PmelQ60696 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PmelQ60696 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PmelQ60696 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PmelQ60696 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PmelQ60696 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PmelQ60696 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PmelQ60696 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PmelQ60696 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PmelQ60696 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PmelQ60696 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PmelQ60696 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PmelQ60696 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PmelQ60696 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PmelQ60696 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PmelQ60696 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PmelQ60696 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PmelQ60696 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PmelQ60696 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PmelQ60696 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PmelQ60696 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PmelQ60696 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PmelQ60696 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PmelQ60696 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PmelQ60696 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PmelQ60696 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PmelQ60696 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PmelQ60696 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PmelQ60696 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PmelQ60696 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PmelQ60696 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PmelQ60696 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PmelQ60696 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PmelQ60696 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PmelQ60696 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PmelQ60696 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PmelQ60696 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PmelQ60696 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PmelQ60696 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PmelQ60696 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PmelQ60696 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PmelQ60696 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PmelQ60696 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PmelQ60696 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PmelQ60696 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PmelQ60696 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PmelQ60696 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PmelQ60696 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PmelQ60696 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PmelQ60696 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PmelQ60696 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PmelQ60696 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PmelQ60696 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PmelQ60696 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PmelQ60696 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PmelQ60696 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PmelQ60696 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms