Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Foxd4Q60688 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Foxd4Q60688 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Foxd4Q60688 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Foxd4Q60688 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Foxd4Q60688 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Foxd4Q60688 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Foxd4Q60688 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Foxd4Q60688 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Foxd4Q60688 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Foxd4Q60688 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Foxd4Q60688 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Foxd4Q60688 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Foxd4Q60688 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Foxd4Q60688 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Foxd4Q60688 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Foxd4Q60688 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Foxd4Q60688 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Foxd4Q60688 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Foxd4Q60688 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Foxd4Q60688 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Foxd4Q60688 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Foxd4Q60688 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Foxd4Q60688 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Foxd4Q60688 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Foxd4Q60688 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Foxd4Q60688 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Foxd4Q60688 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Foxd4Q60688 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Foxd4Q60688 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Foxd4Q60688 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Foxd4Q60688 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Foxd4Q60688 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Foxd4Q60688 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Foxd4Q60688 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Foxd4Q60688 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Foxd4Q60688 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Foxd4Q60688 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Foxd4Q60688 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Foxd4Q60688 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Foxd4Q60688 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Foxd4Q60688 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Foxd4Q60688 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Foxd4Q60688 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Foxd4Q60688 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Foxd4Q60688 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Foxd4Q60688 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Foxd4Q60688 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Foxd4Q60688 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Foxd4Q60688 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Foxd4Q60688 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Foxd4Q60688 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Foxd4Q60688 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Foxd4Q60688 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Foxd4Q60688 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Foxd4Q60688 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Foxd4Q60688 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Foxd4Q60688 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Foxd4Q60688 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Foxd4Q60688 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Foxd4Q60688 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Foxd4Q60688 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Foxd4Q60688 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Foxd4Q60688 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Foxd4Q60688 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms