Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Prdm1Q60636 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms