Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tdrd5Q5VCS6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms