Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Brip1Q5SXJ3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms