Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW4

Med13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13Q5SWW4 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms