Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc42Q5SV66 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms