Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms