Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam71bQ5STT6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam71bQ5STT6 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam71bQ5STT6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam71bQ5STT6 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam71bQ5STT6 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam71bQ5STT6 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam71bQ5STT6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam71bQ5STT6 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam71bQ5STT6 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam71bQ5STT6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam71bQ5STT6 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam71bQ5STT6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam71bQ5STT6 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam71bQ5STT6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam71bQ5STT6 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam71bQ5STT6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam71bQ5STT6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam71bQ5STT6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam71bQ5STT6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam71bQ5STT6 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam71bQ5STT6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam71bQ5STT6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam71bQ5STT6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam71bQ5STT6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam71bQ5STT6 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam71bQ5STT6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam71bQ5STT6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam71bQ5STT6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam71bQ5STT6 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam71bQ5STT6 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam71bQ5STT6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam71bQ5STT6 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam71bQ5STT6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam71bQ5STT6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam71bQ5STT6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam71bQ5STT6 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam71bQ5STT6 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam71bQ5STT6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam71bQ5STT6 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam71bQ5STT6 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam71bQ5STT6 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam71bQ5STT6 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam71bQ5STT6 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam71bQ5STT6 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam71bQ5STT6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam71bQ5STT6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam71bQ5STT6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam71bQ5STT6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam71bQ5STT6 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam71bQ5STT6 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam71bQ5STT6 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam71bQ5STT6 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam71bQ5STT6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam71bQ5STT6 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam71bQ5STT6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam71bQ5STT6 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam71bQ5STT6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam71bQ5STT6 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam71bQ5STT6 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam71bQ5STT6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam71bQ5STT6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam71bQ5STT6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam71bQ5STT6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam71bQ5STT6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam71bQ5STT6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam71bQ5STT6 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam71bQ5STT6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam71bQ5STT6 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam71bQ5STT6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam71bQ5STT6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam71bQ5STT6 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam71bQ5STT6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam71bQ5STT6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam71bQ5STT6 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam71bQ5STT6 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam71bQ5STT6 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam71bQ5STT6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam71bQ5STT6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam71bQ5STT6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam71bQ5STT6 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam71bQ5STT6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam71bQ5STT6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam71bQ5STT6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam71bQ5STT6 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam71bQ5STT6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam71bQ5STT6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam71bQ5STT6 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam71bQ5STT6 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam71bQ5STT6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam71bQ5STT6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam71bQ5STT6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam71bQ5STT6 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam71bQ5STT6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam71bQ5STT6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam71bQ5STT6 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms