Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSL4

Abr, Active breakpoint cluster region-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AbrQ5SSL4 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AbrQ5SSL4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
AbrQ5SSL4 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AbrQ5SSL4 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AbrQ5SSL4 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AbrQ5SSL4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AbrQ5SSL4 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AbrQ5SSL4 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AbrQ5SSL4 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AbrQ5SSL4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AbrQ5SSL4 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AbrQ5SSL4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AbrQ5SSL4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AbrQ5SSL4 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AbrQ5SSL4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AbrQ5SSL4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AbrQ5SSL4 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AbrQ5SSL4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AbrQ5SSL4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AbrQ5SSL4 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AbrQ5SSL4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AbrQ5SSL4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
AbrQ5SSL4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AbrQ5SSL4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AbrQ5SSL4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
AbrQ5SSL4 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AbrQ5SSL4 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AbrQ5SSL4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AbrQ5SSL4 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AbrQ5SSL4 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AbrQ5SSL4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AbrQ5SSL4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AbrQ5SSL4 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AbrQ5SSL4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AbrQ5SSL4 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AbrQ5SSL4 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AbrQ5SSL4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AbrQ5SSL4 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AbrQ5SSL4 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AbrQ5SSL4 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AbrQ5SSL4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AbrQ5SSL4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AbrQ5SSL4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AbrQ5SSL4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AbrQ5SSL4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AbrQ5SSL4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AbrQ5SSL4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AbrQ5SSL4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
AbrQ5SSL4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AbrQ5SSL4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AbrQ5SSL4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AbrQ5SSL4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AbrQ5SSL4 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AbrQ5SSL4 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AbrQ5SSL4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AbrQ5SSL4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AbrQ5SSL4 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
AbrQ5SSL4 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AbrQ5SSL4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AbrQ5SSL4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AbrQ5SSL4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AbrQ5SSL4 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AbrQ5SSL4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AbrQ5SSL4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AbrQ5SSL4 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
AbrQ5SSL4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AbrQ5SSL4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AbrQ5SSL4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
AbrQ5SSL4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AbrQ5SSL4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AbrQ5SSL4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AbrQ5SSL4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AbrQ5SSL4 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AbrQ5SSL4 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AbrQ5SSL4 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AbrQ5SSL4 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AbrQ5SSL4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AbrQ5SSL4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AbrQ5SSL4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AbrQ5SSL4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AbrQ5SSL4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AbrQ5SSL4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AbrQ5SSL4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AbrQ5SSL4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AbrQ5SSL4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AbrQ5SSL4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AbrQ5SSL4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AbrQ5SSL4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AbrQ5SSL4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AbrQ5SSL4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AbrQ5SSL4 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AbrQ5SSL4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AbrQ5SSL4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AbrQ5SSL4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AbrQ5SSL4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AbrQ5SSL4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AbrQ5SSL4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AbrQ5SSL4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AbrQ5SSL4 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AbrQ5SSL4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms