Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TefmQ5SSK3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms