Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGU6

Rtp3, Receptor-transporting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp3Q5QGU6 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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