Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC83

Spata48, Spermatogenesis-associated protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata48Q5NC83 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spata48Q5NC83 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spata48Q5NC83 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spata48Q5NC83 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Spata48Q5NC83 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Spata48Q5NC83 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spata48Q5NC83 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spata48Q5NC83 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spata48Q5NC83 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spata48Q5NC83 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spata48Q5NC83 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spata48Q5NC83 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spata48Q5NC83 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spata48Q5NC83 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spata48Q5NC83 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spata48Q5NC83 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spata48Q5NC83 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Spata48Q5NC83 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spata48Q5NC83 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spata48Q5NC83 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spata48Q5NC83 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spata48Q5NC83 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spata48Q5NC83 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spata48Q5NC83 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spata48Q5NC83 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spata48Q5NC83 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spata48Q5NC83 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Spata48Q5NC83 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spata48Q5NC83 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spata48Q5NC83 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spata48Q5NC83 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms