Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC41

1810065E05Rik, RIKEN cDNA 1810065E05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810065E05RikQ5NC41 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
1810065E05RikQ5NC41 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
1810065E05RikQ5NC41 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
1810065E05RikQ5NC41 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
1810065E05RikQ5NC41 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
1810065E05RikQ5NC41 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
1810065E05RikQ5NC41 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
1810065E05RikQ5NC41 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
1810065E05RikQ5NC41 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
1810065E05RikQ5NC41 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
1810065E05RikQ5NC41 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
1810065E05RikQ5NC41 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
1810065E05RikQ5NC41 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
1810065E05RikQ5NC41 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
1810065E05RikQ5NC41 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
1810065E05RikQ5NC41 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
1810065E05RikQ5NC41 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
1810065E05RikQ5NC41 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
1810065E05RikQ5NC41 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
1810065E05RikQ5NC41 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
1810065E05RikQ5NC41 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
1810065E05RikQ5NC41 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
1810065E05RikQ5NC41 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
1810065E05RikQ5NC41 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
1810065E05RikQ5NC41 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
1810065E05RikQ5NC41 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
1810065E05RikQ5NC41 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
1810065E05RikQ5NC41 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
1810065E05RikQ5NC41 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
1810065E05RikQ5NC41 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
1810065E05RikQ5NC41 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
1810065E05RikQ5NC41 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
1810065E05RikQ5NC41 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
1810065E05RikQ5NC41 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
1810065E05RikQ5NC41 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
1810065E05RikQ5NC41 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
1810065E05RikQ5NC41 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
1810065E05RikQ5NC41 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
1810065E05RikQ5NC41 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
1810065E05RikQ5NC41 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
1810065E05RikQ5NC41 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
1810065E05RikQ5NC41 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
1810065E05RikQ5NC41 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
1810065E05RikQ5NC41 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms