Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms