Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vps41Q5KU39 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Vps41Q5KU39 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Vps41Q5KU39 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Vps41Q5KU39 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vps41Q5KU39 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vps41Q5KU39 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms