Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms