Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTW2

Sfmbt2, Scm-like with four MBT domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt2Q5DTW2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Sfmbt2Q5DTW2 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms