Protein–RNA interactions for Protein: Q571J5

Znf354c, Zinc finger protein 354C, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf354cQ571J5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Znf354cQ571J5 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Znf354cQ571J5 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Znf354cQ571J5 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Znf354cQ571J5 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Znf354cQ571J5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Znf354cQ571J5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Znf354cQ571J5 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Znf354cQ571J5 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Znf354cQ571J5 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Znf354cQ571J5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Znf354cQ571J5 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Znf354cQ571J5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Znf354cQ571J5 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Znf354cQ571J5 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Znf354cQ571J5 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Znf354cQ571J5 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Znf354cQ571J5 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Znf354cQ571J5 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Znf354cQ571J5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Znf354cQ571J5 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Znf354cQ571J5 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Znf354cQ571J5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Znf354cQ571J5 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Znf354cQ571J5 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Znf354cQ571J5 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Znf354cQ571J5 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Znf354cQ571J5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Znf354cQ571J5 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Znf354cQ571J5 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Znf354cQ571J5 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Znf354cQ571J5 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Znf354cQ571J5 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Znf354cQ571J5 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Znf354cQ571J5 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Znf354cQ571J5 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Znf354cQ571J5 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Znf354cQ571J5 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms