Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Spire1Q52KF3 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms