Protein–RNA interactions for Protein: Q505D9

Trim67, Tripartite motif-containing protein 67, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim67Q505D9 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim67Q505D9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim67Q505D9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim67Q505D9 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim67Q505D9 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim67Q505D9 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim67Q505D9 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim67Q505D9 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim67Q505D9 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim67Q505D9 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim67Q505D9 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim67Q505D9 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim67Q505D9 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim67Q505D9 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim67Q505D9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim67Q505D9 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim67Q505D9 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim67Q505D9 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim67Q505D9 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim67Q505D9 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim67Q505D9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim67Q505D9 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim67Q505D9 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim67Q505D9 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim67Q505D9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim67Q505D9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim67Q505D9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim67Q505D9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim67Q505D9 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim67Q505D9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim67Q505D9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim67Q505D9 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim67Q505D9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim67Q505D9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim67Q505D9 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim67Q505D9 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim67Q505D9 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim67Q505D9 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim67Q505D9 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim67Q505D9 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim67Q505D9 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim67Q505D9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim67Q505D9 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim67Q505D9 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim67Q505D9 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim67Q505D9 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim67Q505D9 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim67Q505D9 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim67Q505D9 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim67Q505D9 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim67Q505D9 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim67Q505D9 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim67Q505D9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim67Q505D9 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim67Q505D9 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim67Q505D9 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim67Q505D9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim67Q505D9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim67Q505D9 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim67Q505D9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim67Q505D9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim67Q505D9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim67Q505D9 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim67Q505D9 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim67Q505D9 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim67Q505D9 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Trim67Q505D9 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim67Q505D9 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim67Q505D9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim67Q505D9 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim67Q505D9 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim67Q505D9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim67Q505D9 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim67Q505D9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim67Q505D9 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim67Q505D9 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim67Q505D9 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim67Q505D9 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim67Q505D9 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim67Q505D9 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim67Q505D9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim67Q505D9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim67Q505D9 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim67Q505D9 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim67Q505D9 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim67Q505D9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim67Q505D9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim67Q505D9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim67Q505D9 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim67Q505D9 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim67Q505D9 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim67Q505D9 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim67Q505D9 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim67Q505D9 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim67Q505D9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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