Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA36

Ccdc84, Coiled-coil domain-containing protein 84, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc84Q4VA36 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc84Q4VA36 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms