Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc3lQ4KL14 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms