Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0K9

Snhg11, Small nucleolar RNA host gene 11, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snhg11Q4G0K9 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms