Protein–RNA interactions for Protein: Q45KJ6

Lin28b, Protein lin-28 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28bQ45KJ6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lin28bQ45KJ6 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lin28bQ45KJ6 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lin28bQ45KJ6 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lin28bQ45KJ6 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lin28bQ45KJ6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lin28bQ45KJ6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lin28bQ45KJ6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lin28bQ45KJ6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lin28bQ45KJ6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lin28bQ45KJ6 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lin28bQ45KJ6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lin28bQ45KJ6 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lin28bQ45KJ6 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lin28bQ45KJ6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lin28bQ45KJ6 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lin28bQ45KJ6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lin28bQ45KJ6 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lin28bQ45KJ6 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lin28bQ45KJ6 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lin28bQ45KJ6 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Lin28bQ45KJ6 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lin28bQ45KJ6 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lin28bQ45KJ6 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lin28bQ45KJ6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lin28bQ45KJ6 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Lin28bQ45KJ6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lin28bQ45KJ6 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lin28bQ45KJ6 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lin28bQ45KJ6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lin28bQ45KJ6 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lin28bQ45KJ6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lin28bQ45KJ6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lin28bQ45KJ6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lin28bQ45KJ6 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lin28bQ45KJ6 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lin28bQ45KJ6 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lin28bQ45KJ6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lin28bQ45KJ6 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lin28bQ45KJ6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lin28bQ45KJ6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lin28bQ45KJ6 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lin28bQ45KJ6 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lin28bQ45KJ6 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lin28bQ45KJ6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lin28bQ45KJ6 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lin28bQ45KJ6 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lin28bQ45KJ6 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lin28bQ45KJ6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lin28bQ45KJ6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lin28bQ45KJ6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lin28bQ45KJ6 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lin28bQ45KJ6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lin28bQ45KJ6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lin28bQ45KJ6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lin28bQ45KJ6 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lin28bQ45KJ6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lin28bQ45KJ6 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lin28bQ45KJ6 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lin28bQ45KJ6 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lin28bQ45KJ6 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lin28bQ45KJ6 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lin28bQ45KJ6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lin28bQ45KJ6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lin28bQ45KJ6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lin28bQ45KJ6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lin28bQ45KJ6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lin28bQ45KJ6 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lin28bQ45KJ6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lin28bQ45KJ6 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lin28bQ45KJ6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lin28bQ45KJ6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lin28bQ45KJ6 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lin28bQ45KJ6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lin28bQ45KJ6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lin28bQ45KJ6 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lin28bQ45KJ6 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lin28bQ45KJ6 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lin28bQ45KJ6 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lin28bQ45KJ6 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lin28bQ45KJ6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lin28bQ45KJ6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lin28bQ45KJ6 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lin28bQ45KJ6 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lin28bQ45KJ6 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lin28bQ45KJ6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lin28bQ45KJ6 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lin28bQ45KJ6 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lin28bQ45KJ6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lin28bQ45KJ6 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lin28bQ45KJ6 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lin28bQ45KJ6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lin28bQ45KJ6 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lin28bQ45KJ6 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lin28bQ45KJ6 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lin28bQ45KJ6 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lin28bQ45KJ6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lin28bQ45KJ6 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lin28bQ45KJ6 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lin28bQ45KJ6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms