Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Snx25Q3ZT31 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx25Q3ZT31 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx25Q3ZT31 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx25Q3ZT31 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx25Q3ZT31 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx25Q3ZT31 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx25Q3ZT31 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx25Q3ZT31 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx25Q3ZT31 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx25Q3ZT31 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx25Q3ZT31 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx25Q3ZT31 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx25Q3ZT31 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx25Q3ZT31 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx25Q3ZT31 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx25Q3ZT31 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx25Q3ZT31 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx25Q3ZT31 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx25Q3ZT31 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx25Q3ZT31 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx25Q3ZT31 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx25Q3ZT31 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx25Q3ZT31 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx25Q3ZT31 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx25Q3ZT31 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx25Q3ZT31 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx25Q3ZT31 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx25Q3ZT31 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx25Q3ZT31 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx25Q3ZT31 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx25Q3ZT31 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx25Q3ZT31 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx25Q3ZT31 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx25Q3ZT31 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx25Q3ZT31 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx25Q3ZT31 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx25Q3ZT31 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx25Q3ZT31 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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Snx25Q3ZT31 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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Snx25Q3ZT31 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx25Q3ZT31 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx25Q3ZT31 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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Snx25Q3ZT31 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx25Q3ZT31 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx25Q3ZT31 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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Snx25Q3ZT31 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx25Q3ZT31 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx25Q3ZT31 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx25Q3ZT31 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx25Q3ZT31 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx25Q3ZT31 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
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Snx25Q3ZT31 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx25Q3ZT31 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
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Snx25Q3ZT31 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx25Q3ZT31 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
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Snx25Q3ZT31 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx25Q3ZT31 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
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