Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q4

Pydc3, Pyrin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pydc3Q3V3Q4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms