Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms