Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW21

Clpsl2, Colipase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clpsl2Q3UW21 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Clpsl2Q3UW21 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clpsl2Q3UW21 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clpsl2Q3UW21 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clpsl2Q3UW21 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clpsl2Q3UW21 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clpsl2Q3UW21 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clpsl2Q3UW21 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clpsl2Q3UW21 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clpsl2Q3UW21 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clpsl2Q3UW21 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clpsl2Q3UW21 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clpsl2Q3UW21 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clpsl2Q3UW21 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Clpsl2Q3UW21 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clpsl2Q3UW21 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clpsl2Q3UW21 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clpsl2Q3UW21 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clpsl2Q3UW21 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clpsl2Q3UW21 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clpsl2Q3UW21 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clpsl2Q3UW21 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clpsl2Q3UW21 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clpsl2Q3UW21 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clpsl2Q3UW21 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clpsl2Q3UW21 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clpsl2Q3UW21 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clpsl2Q3UW21 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clpsl2Q3UW21 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clpsl2Q3UW21 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clpsl2Q3UW21 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clpsl2Q3UW21 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Clpsl2Q3UW21 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clpsl2Q3UW21 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clpsl2Q3UW21 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clpsl2Q3UW21 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clpsl2Q3UW21 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clpsl2Q3UW21 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clpsl2Q3UW21 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clpsl2Q3UW21 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clpsl2Q3UW21 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clpsl2Q3UW21 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clpsl2Q3UW21 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clpsl2Q3UW21 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clpsl2Q3UW21 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clpsl2Q3UW21 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clpsl2Q3UW21 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clpsl2Q3UW21 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clpsl2Q3UW21 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clpsl2Q3UW21 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clpsl2Q3UW21 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clpsl2Q3UW21 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clpsl2Q3UW21 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clpsl2Q3UW21 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clpsl2Q3UW21 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clpsl2Q3UW21 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clpsl2Q3UW21 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clpsl2Q3UW21 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Clpsl2Q3UW21 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clpsl2Q3UW21 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clpsl2Q3UW21 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Clpsl2Q3UW21 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clpsl2Q3UW21 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clpsl2Q3UW21 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms