Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Nr1d1Q3UV55 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms