Protein–RNA interactions for Protein: Q3USQ7

Syndig1l, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1lQ3USQ7 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syndig1lQ3USQ7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Syndig1lQ3USQ7 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Syndig1lQ3USQ7 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Syndig1lQ3USQ7 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syndig1lQ3USQ7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syndig1lQ3USQ7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syndig1lQ3USQ7 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syndig1lQ3USQ7 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syndig1lQ3USQ7 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syndig1lQ3USQ7 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syndig1lQ3USQ7 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syndig1lQ3USQ7 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syndig1lQ3USQ7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms