Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm28047Q3US59 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm28047Q3US59 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms