Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQ97

Gm5460, Predicted gene 5460, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5460Q3UQ97 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
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Gm5460Q3UQ97 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5460Q3UQ97 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5460Q3UQ97 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5460Q3UQ97 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5460Q3UQ97 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Gm5460Q3UQ97 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5460Q3UQ97 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5460Q3UQ97 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5460Q3UQ97 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5460Q3UQ97 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5460Q3UQ97 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5460Q3UQ97 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5460Q3UQ97 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5460Q3UQ97 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Gm5460Q3UQ97 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5460Q3UQ97 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Gm5460Q3UQ97 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Gm5460Q3UQ97 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Gm5460Q3UQ97 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Gm5460Q3UQ97 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Gm5460Q3UQ97 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Gm5460Q3UQ97 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5460Q3UQ97 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5460Q3UQ97 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5460Q3UQ97 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5460Q3UQ97 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5460Q3UQ97 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Gm5460Q3UQ97 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5460Q3UQ97 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Gm5460Q3UQ97 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Gm5460Q3UQ97 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5460Q3UQ97 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Gm5460Q3UQ97 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5460Q3UQ97 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5460Q3UQ97 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5460Q3UQ97 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5460Q3UQ97 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5460Q3UQ97 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5460Q3UQ97 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5460Q3UQ97 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5460Q3UQ97 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5460Q3UQ97 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5460Q3UQ97 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5460Q3UQ97 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5460Q3UQ97 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5460Q3UQ97 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5460Q3UQ97 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5460Q3UQ97 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5460Q3UQ97 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5460Q3UQ97 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5460Q3UQ97 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5460Q3UQ97 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5460Q3UQ97 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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